Testes de confirmação são realizados quando IgG e IgM anti Borrelia são positivos ou quando o resultado é inconclusivo. Se o teste é positivo apenas para anticorpos IgM, a infecção é muito recente, ou pode significar um resultado falso positivo. Se o resultado dos testes de IgM e IgG por Western Blot forem positivos, é provável que o indivíduo tem a doença de Lyme e ou a infecção está numa fase tardia ou contraída no passado.