Estes testes de confirmação são realizados quando a IgG e IgM contra Borrelia dão positivo ou quando o resultado é inconclusivo.Se apenas o teste é anticorpos IgM positivos, a infecção é muito recente, mas também poderia ser o caso de que foi um resultado falso positivo. Se o resultado dos testes de IgM e IgG por Western Blot forem positivos, é provável que o indivíduo tem a doença de Lyme e ou a infecção esta numa fase tardia ou contraída no passado.