O CD3 está presente em todas as fases de desenvolvimento dos linfócitos T do tipo auxilar (T4) e citotóxico (T8), participando da ativação do TCR.
Este marcador é útil na identificação de células T, estando presente em leucemias e linfomas das células T, e serve como marcador de diferenciação entre as leucemias/linfomas do tipo B. Além de ser indicado para acompanhar quadros de imunodeficiência, tais como as decorrentes de infecção pelo vírus HIV, e em quadros de doenças autoimunes.