A análise das proteínas totais no LCR é importante na detecção da permeabilidade acrescida da barreira hematoencefálica às proteínas do plasma ou para detectar produção intratecal acrescida de imunoglobulinas. A permeabilidade acrescida da barreira hematoencefálica pode resultar de determinadas condições, nomeadamente tumor cerebral, hemorragia intra-cerebral ou inflamação provocada por meningite bacteriana ou viral, encefalite ou poliomielite. A determinação de síntese intratecal de imunoglobulinas acrescida é importante no diagnóstico de doenças associadas à desmielinização, tais como a esclerose múltipla.